Το Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας προκηρύσσει προγράμματα σπουδών δευτέρου κύκλου, σε διάφορους κλάδους. Πιο αναλυτικώς, οι προκηρύξεις των προγραμμάτων αφορούν τα τμήματα Οικονομικών, Βιοχημείας, ΗΜΜΥ, ενώ παρέχονται πληροφορίες στους ακόλουθους συνδέσμους:
Προηγμένες Πειραματικές και Υπολογιστικές Βιοεπιστήμες»
Επιστήμη και Τεχνολογία Ηλεκτρολόγων Μηχανικών και Μηχανικών Υπολογιστών